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唐迪
作品数:
1
被引量:4
H指数:1
供职机构:
西南交通大学生命科学与工程学院
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发文基金:
国家自然科学基金
国家科技重大专项
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相关领域:
生物学
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合作作者
冯斌
西南交通大学生命科学与工程学院
李娟娟
西南交通大学生命科学与工程学院
宋涛
西南交通大学生命科学与工程学院
周嘉裕
西南交通大学生命科学与工程学院
谭睿
西南交通大学生命科学与工程学院
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O
机构
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西南交通大学
作者
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廖海
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王万军
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谭睿
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周嘉裕
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宋涛
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李娟娟
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唐迪
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冯斌
传媒
1篇
生物技术
年份
1篇
2015
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川芎咖啡酸-3-O-甲基转移酶的同源建模与分子模拟对接
被引量:4
2015年
[目的]分析川芎咖啡酸-3-O甲基转移酶(Caffeic acid-3-Omethyltransferase,COMT)序列特征、蛋白结构和活性位点。[方法]以紫花苜蓿中COMT的晶体结构为模板,利用同源建模构建川芎(Ligusticum chuanxiong Hort)COMT的三维模型。[结果]经过动力学优化后,川芎COMT的三维模型与紫花苜蓿COMT的结构极为相似,主要由α-螺旋和β-折叠构成,其中α-螺旋占37.26%、β-折叠占10.41%、无规卷曲占52.33%。川芎COMT含有两个重要的结构域:咖啡酸结合域与S-腺苷甲硫氨酸结合域,主要通过氢键与范德华力结合,其中咖啡酸与川芎COMT分子中的Asp208和Gly210形成氢键,S-腺苷甲硫氨酸与川芎COMT分子中的Ser186、Thr213、Ala215、Thr216、Trp268及Asp272等残基形成氢键。[结论]该文得到川芎COMT的序列特征、蛋白结构和活性位点,为该类COMT的催化机理研究和分子工程改造奠定基础。
宋涛
冯斌
李娟娟
唐迪
王万军
廖海
周嘉裕
谭睿
关键词:
同源建模
川芎
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