刘青青
- 作品数：2 被引量：82H指数：2
- 供职机构：西北农林科技大学动物医学院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 非模式生物转录组研究被引量：79
- 2013年
- 转录组代表细胞或组织内全部的RNA转录本(RNA transcripts),反映不同生命阶段、不同组织类型、不同生理状态以及不同环境条件下表达的基因。转录组研究可以从整体水平上反映细胞中基因表达情况及其调控规律。非模式生物(Non-model organism)具有许多模式生物不具备的特征,其转录组研究对解决基因进化、遗传育种以及生态等诸多方面的问题具有重要意义。但由于非模式生物缺乏参考基因组信息,传统的转录组研究方法操作复杂,实验周期长,花费大,使得其转录组研究进展缓慢。新一代高通量RNA测序技术(RNA-seq)完全改变了转录组学的研究模式,迅速成为研究非模式生物转录组的先进技术。文章详细论述了近年来利用RNA-seq技术进行非模式生物转录组研究的进展情况,从样品准备、高通量DNA测序以及生物信息学分析等方面介绍了利用RNA-seq技术研究非模式生物转录组的一般流程及方法,并对其中有待进一步研究的问题进行了展望。
- 刘红亮郑丽明刘青青权富生张涌
- 关键词：转录组RNA-SEQ
- 小鼠早期胚胎发育过程中的DNA去甲基化被引量：3
- 2013年
- 表观遗传修饰在基因转录与表达、细胞生长与分化以及动物个体正常发育等过程中都具有重要的调控作用。表观遗传修饰发生异常,会引起机体生长发育中的各种异常。哺乳动物从精卵受精到附植前的胚胎早期发育阶段会发生重要的表观遗传重编程,主要包括DNA甲基化和组蛋白修饰。精卵受精后DNA发生主动和被动2种方式的去甲基化。本文主要综述了与DNA甲基化相关的蛋白和早期胚胎发育过程中的去甲基化机制,并对小鼠附植前胚胎发育过程中的DNA甲基化的动态变化进行了详细的论述。
- 刘青青郑丽明刘红亮苏建民权富生张涌
- 关键词：小鼠早期胚胎
