郑如玉
- 作品数:3 被引量:4H指数:1
- 供职机构:内蒙古农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 柠条干旱胁迫转录组数据分析以及部分基因功能验证
- 柠条是柠条锦鸡儿(Caragana korshinskii)、中间锦鸡儿(Caragana intermedia)和小叶锦鸡儿(Caragana microphylla)的统称,属于豆科锦鸡儿属多年生灌木,是干旱草原、荒...
- 杨杞韩晓敏于秀敏赵娜王光霞万永青杨飞芸李娜毛铭铢郑如玉刘坤岳文冉刘建政杨天瑞任方媛红格日王燕飞牛肖翠于爽王瑞刚李国婧
- 关键词:柠条转录组功能分析转录因子基因家族
- 柠条干旱胁迫转录组数据分析以及基因功能验证
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- 关键词:柠条转录组功能分析转录因子基因家族
- 中间锦鸡儿干旱转录组SSR标记的开发及遗传多样性研究被引量:4
- 2017年
- 利用中间锦鸡儿干旱转录组数据自主开发、筛选具有多态性的SSR标记;在此基础上,选取了内蒙古地区10个居群的中间锦鸡儿种质资源为试验材料,对其遗传多样性展开了系统研究。研究如下:中间锦鸡儿干旱转录组共搜索到404个SSR标记,分布于349条Unigenes序列上,出现频率为14.78%。其中二核苷酸重复是主要的类型,占总SSRs的64.90%;其次是三核苷酸重复,占总SSRs的33.70%;二核苷酸重复基元中以AG/CT和GA/TC为优势重复基元,占总SSRs的29.45%,三核苷酸重复基元以AAG/CTT为主,占总SSRs的5.69%。成功设计了76对引物并筛选出条带清晰、多态性好、重复性好的7对引物进行遗传多样性分析。共检测到29个等位基因(Na),有效等位基因数为1.101~2.007,Nei’s多样性指数为0.254;Shannon多样性指数(I)为0.193~0.709,平均每位点I值为0.482;种群间遗传距离(GD)的范围是0.002 7~0.068 8,遗传一致度(GI)的范围是0.933 5~0.997 3,采用Nei's遗传关系用UPGMA进行聚类,10个居群分为2个亚群,包头市百灵庙镇和乌兰察布市凉城县聚为一个亚群,其余种群聚为另一个亚群。中间锦鸡儿种群间平均近交系数(Fis)大于0且基因流为3.726,遗传距离与地理距离相关系数R^2=0.023。分析表明供试材料的遗传多样性较低,可能是中间锦鸡儿居群受到自然和人为干预较多,遗传交流大所导致的。
- 郑如玉刘坤杨杞杨飞芸杨天瑞宝力德王瑞刚
- 关键词:中间锦鸡儿SSR