施肖堃
- 作品数：12 被引量：55H指数：4
- 供职机构：福建省农业科学院更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目福建省种业创新与产业化工程项目福建省属公益类科研院所基本科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学经济管理医药卫生更多>>
- 双孢蘑菇6个菌株不同发育阶段的转录组分析被引量：1
- 2019年
- 【目的】通过多个双孢蘑菇菌株不同发育阶段的差异转录组分析,为进一步验证双孢蘑菇发育相关基因及探讨其分子机理奠定基础。【方法】对双孢蘑菇主栽品种As2796及其亲本02、8213,其回交子代W192,以及国外野生菌株ARP159、国内野生菌株AgLH830共6个具有重要代表性的菌株子实体原基期、幼菇期、采摘期、开伞期等4个不同发育阶段共24个样品进行转录组测序,并与双孢蘑菇参考基因组序列进行比对,根据比对结果进行各基因在不同样品中的表达量分析及差异表达基因识别,发掘新基因与共同基因的差异表达,并进行各数据库的基因功能注释。【结果】结果共鉴定到10 660个转录本,发掘新基因677个,其中237个得到功能注释。与原基期相比,6个菌株在幼菇期、采摘期和开伞期分别有49、82、73个共同差异表达基因,其中有13个是相同的基因。【结论】发现了一批在双孢蘑菇子实体不同发育阶段具有显著差异表达的基因,筛选出不同菌株不同阶段的共有差异基因,对双孢蘑菇子实体发育中重要的差异基因进行了注释与探讨。
- 施肖堃卢园萍蔡志欣郭仲杰陈美元廖剑华
- 关键词：双孢蘑菇子实体发育转录组测序差异表达基因
- 中国真姬菇产业发展的现状及展望被引量：7
- 2012年
- 文章简述了真姬菇在我国食用菌产业的地位,以及真姬菇的最新研究进展这2个方面。同时,根据我国真姬菇产业发展的现状,总结了该产业存在的若干问题,并简要概括了相关的解决方案。
- 施肖堃曾辉
- 关键词：真姬菇栽培方式活性物质
- 双孢蘑菇Septin基因Ab.Cdc3的克隆与分析被引量：1
- 2018年
- 具有GTPase活性的Septin蛋白广泛存在于除植物外的所有真核生物中,其功能多样。采用tBlastn将灰盖鬼伞Coprinuscinereus中与菌柄伸长相关的Septin蛋白Cc.Cdc3与双孢蘑菇基因组数据进行比对,在双孢蘑菇基因组中找到Cc.Cdc3同源蛋白编码基因Ab.Cdc3。生物信息学分析结果表明,Ab.Cdc3蛋白序列具有保守GTPase结构功能域。通过荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)方法分析Ab.Cdc3在不同生长阶段的表达模式,结果显示该基因在子实体菌柄中表达量较菌丝、原基和菌盖中的表达量高;采后不同保藏时间样品Ab.Cdc3基因表达分析结果显示,在采后0h表达量显著高于采后12h和48h;这些结果为进一步研究该基因在双孢蘑菇生长发育中的功能提供参考。
- 卢园萍郭仲杰蔡志欣施肖堃陈美元廖剑华王泽生
- 关键词：食用菌实时荧光定量PCR保守结构域GTP结合蛋白
- 一种工厂化生产香菇透气菌包的方法
- 本发明的目的是提供一种工厂化生产香菇透气菌包的技术：采用透气塑料袋作为香菇栽培的菌包容器，经过香菇菌种的活化培养、制备麦粒栽培种的培养以及将栽培种接种于透气袋菌包的菌包培养步骤，培养出香菇透气菌包，通过转色，进行层架式工...
- 曾辉杨菁程翊戴建清王泽生曾志恒施肖堃杨雷杨辉黄小菁梁栋
- 文献传递
- 一种工厂化生产香菇透气菌包的方法
- 本发明的目的是提供一种工厂化生产香菇透气菌包的技术：采用透气塑料袋作为香菇栽培的菌包容器，经过香菇菌种的活化培养、制备麦粒栽培种的培养以及将栽培种接种于透气袋菌包的菌包培养步骤，培养出香菇透气菌包，通过转色，进行层架式工...
- 曾辉杨菁程翊戴建清王泽生曾志恒施肖堃杨雷杨辉黄小菁梁栋
- 文献传递
- 利用ISSR标记鉴定双孢蘑菇的传统菌株类型被引量：3
- 2019年
- 具有优质或高产性状的双孢蘑菇传统菌株是品种改良的重要亲本来源。通过对双孢蘑菇具有代表性的24个优质类型和24个高产类型传统菌株的ISSR-PCR分析,发现引物ISSR834、ISSR835、ISSR807共扩增产生7条能判别传统菌株优质类型或高产类型的特异性标记条带,可以在双孢蘑菇定向杂交育种中方便地区分和鉴定传统菌株亲本的优质或高产性状。
- 施肖堃郭仲杰蔡志欣卢园萍陈美元廖剑华
- 关键词：双孢蘑菇ISSRDNA标记
- 响应面法优化双孢蘑菇菌株W38液体菌种培养的研究被引量：6
- 2017年
- 利用Design-Expert软件,在前期单因素试验的基础上,采用Plackett-Burman设计和中心组合设计对双孢蘑菇新菌株W38液体菌种培养基及培养条件进行优化。根据响应面分析法建立模型并确定其最佳的培养基和培养条件为:小米粉49.90g·L^(-1),黄豆粉13.60g·L^(-1),KH_2PO_4 2.00g·L^(-1),MgSO_4·7H_2O 1.067 5g·L^(-1),初始pH 6.5,发酵时间7d,发酵温度24℃,摇瓶转速180r·min^(-1)。在此条件下,双孢蘑菇菌株W38液体菌种的菌丝体每100mL生物量可达2.35g,与初始培养条件下的菌丝体生物量相比提高了3.05倍,平均菌丝生长速度加快了14.7%。
- 曾志恒程翊曾辉杨雷廖剑华施肖堃蔡志英戴建清
- 关键词：双孢蘑菇液体菌种响应面
- 双孢蘑菇As2796子实体发育转录组测序分析被引量：9
- 2018年
- 对双孢蘑菇As2796子实体发育4个不同阶段样品的转录组进行测序,并与双孢蘑菇参考基因组进行序列比对。共比对到9 207个转录本,发掘新基因393个,其中164个得到功能注释。基于比对结果进行各基因在不同样品中的表达量分析,识别差异表达基因,发现原基期与其他3个不同发育时期有316个共同差异基因。对差异基因进行功能注释和富集分析,可为进一步研究双孢蘑菇子实体生长发育的相关基因奠定基础。
- 施肖堃蔡志欣郭仲杰卢园萍陈美元廖剑华王泽生
- 关键词：双孢蘑菇子实体发育转录组测序
- 18个双孢蘑菇核心种质的重测序初步分析被引量：2
- 2019年
- 【目的】通过对双孢蘑菇不同类型核心种质的基因组重测序分析,探讨双孢蘑菇不同类型菌株间基因组存在的差异及开发相关分子标记。【方法】对双孢蘑菇国内外杂交菌株、野生菌株、高产型或优质型传统菌株、棕色菌株、不育菌株等共18株核心种质进行基因组重测序,应用不同的生物信息学处理软件,对测序得到的原始reads序列与双孢蘑菇参考基因组H97序列进行比对,同时基于比对结果进行SNP、SV检测,通过检测结果对多态性标记分布进行统计并实现DNA水平差异基因挖掘和差异基因功能注释等。【结果】样品测序共获得21.63 G数据量,Q30平均达到89.10%。样品的reads与参考基因组H97的比对效率平均为82.50%,基因组覆盖度为96.32%,平均深度分别在33X左右。基于测序数据与参考基因组的比对结果,共检测获得约813 768个SNP,53 840个InDel,平均每个个体获得924个SV变异。【结论】国内外菌株的亲缘关系表明As2796系列与U1系列是世界上并列的两大双孢蘑菇杂交品系。
- 施肖堃蔡志欣郭仲杰卢园萍陈美元廖剑华
- 关键词：基因组SNPINDEL
- 双孢蘑菇发酵液氨基氮含量测定方法的研究被引量：2
- 2019年
- 建立双孢蘑菇(Agaricus bisporus)发酵液氨基氮含量的测定方法。以甘氨酸为对照品,采用茚三酮比色法,测定了双孢蘑菇发酵液氨基氮的含量。研究结果表明,在1%茚三酮显色剂用量1.5 mL,pH 6.5,沸水浴加热30 min,570 nm波长条件下进行测定,氨基氮的平均加样回收率为100.4%(RSD为1.55%)。茚三酮比色法测定发酵液氨基氮含量的方法操作简便、准确可靠、重复性良好。
- 曾志恒曾辉程翊施肖堃谢神斌戴建清
- 关键词：双孢蘑菇氨基氮茚三酮比色法
