徐珺
- 作品数:2 被引量:1H指数:1
- 供职机构:大连交通大学更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 基于加权相对熵的二阶马尔可夫模型的进化树重构被引量:1
- 2013年
- 利用加权相对熵的二阶马尔可夫模型的基本原理,对DNA序列进行比较.DNA序列由4个字符A、T、C、G构成的序列,将其视为一个马尔可夫链,取状态空间Ι={A,T,C,G},使用二阶转移概率矩阵来描述DNA序列,得到DNA序列的特征值,进而利用特征值定义DNA序列的相似性度量,得到能够对DNA序列进行比较的新方法,并利用这个方法对30个物种的线粒体DNA序列进行分类,通过加权相对熵得到距离矩阵的非比对方法构建的进化树划分更加清晰,准确度更高.
- 白凤兰徐珺刘立伟夏阳
- 关键词:进化树
- 基于二阶马尔可夫模型的生物序列比较及进化树构建
- 在20世纪,随着人类基因组计划中精确的DNA全序列图的完成,近年来基因库中的碱基数目大量增长,为了能够管理好这些数据并挖掘出有用的生物信息并分析它,众多的生物学家、数学家、计算机科学家积极的在这个新兴领域中进行研究,生物...
- 徐珺
- 关键词:进化树