祁宏
- 作品数:7 被引量:27H指数:3
- 供职机构:云南农业大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金:云南省应用基础研究基金云南省应用基础研究计划面上项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 云南中甸牦牛的遗传多样性研究被引量:11
- 2009年
- 中旬牦牛是产于滇西北高原的地方品种,为了从分子水平阐明其种质特性,以对其有效保护提供遗传学依据,本研究利用分布在黄牛15条染色体上的15个微卫星标记对中旬牦牛45个样品进行了群体遗传变异分析。共检测到62个等位基因,每个座位的等位基因数从2到6不等,有效等位基因数在1.8243~4.4800,平均每个座位等位基因数4.1333±0.8338个,有效等位基因数3.3645±0.7474个,群体平均表观杂合度、期望杂合度及平均多态信息含量分别为0.9599±0.0973、0.6852±0.0879和0.6311±0.1057。结果表明,中旬牦牛群体遗传变异丰富。
- 田应华钱林东凌军刘丽仙霍金龙祁宏苗永旺
- 关键词:中甸牦牛微卫星标记杂合度多态信息含量
- 水牛κ-酪蛋白基因(CSN3)外显子4序列多态性研究被引量:3
- 2012年
- 分别设计位于CSN3 5个外显子旁侧引物,采用DNA测序法对沼泽型和河流型水牛CSN3编码区结构进行了分析,并对10个水牛群体共106个样本CSN3第4外显子序列进行了变异检测。结果表明,两类水牛CSN3编码区由848个核苷酸组成,包括ORF序列573bp、5′-UTR序列69bp和3′-UTR序列206bp。在水牛CSN3第4外显子中共检测到4个SNP,其中c.445G>A,c.467C>T和c.516A>C为异义替换,导致相应的κ-CN成熟肽中氨基酸发生p.Val128Ile、p.Thr135Ile和p.Glu151Asp改变,c.467C>T和c.516A>C替换可能对κ-CN功能产生了影响。群体遗传分析表明,在河流型水牛中,等位基因c.445G、c.467C、c.471C和c.516A均为优势等位基因,而在沼泽型水牛中,仅c.445G、c.467C和c.471C为优势等位基因,河流型和沼泽型水牛的遗传差异主要体现在SNP516位点的群体遗传组成上。
- 祁宏刘丽仙袁峰李大林袁跃云苗永旺
- 关键词:河流型水牛沼泽型水牛Κ-酪蛋白基因多态性
- 12个水牛群体催乳素基因第4外显子遗传特征分析被引量:7
- 2010年
- 催乳素对水牛乳腺发育、泌乳和乳蛋白基因的表达有明显的调控作用。该研究采用直接测序并结合PCR-SSCP技术,分析沼泽型水牛和河流型水牛12个群体385个个体的催乳素基因(PRL)第4外显子(exon4)的遗传特征。结果表明:水牛PRLexon4由180个核苷酸组成,在不同物种中具有高度保守性。序列分析发现水牛中该外显子的第109位碱基处有C>T替换,为沉默突变,与泌乳性状之间无显著相关性。在9个沼泽型水牛群体中均检测到该突变位点,其中PBA基因在7个沼泽型水牛群体中为优势基因,PBB基因在德宏和富钟群体中为优势基因,沼泽型水牛群体中PBA基因频率在0.400~0.917之间,群体平均值为0.629±0.049,具有地域分布特征。在3个河流型水牛群体中,第109位核苷酸处均为C,未检测到多态。提示河流型水牛与沼泽型水牛已有较大的遗传分化。
- 袁峰苗永旺李大林汤守锟许政霍金龙祁宏
- 关键词:河流型水牛沼泽型水牛催乳素PCR-SSCP
- 牛α_(S1)酪蛋白基因变异及其与生产性状的关系被引量:6
- 2009年
- αS1酪蛋白是牛乳中含量最高的蛋白,其基因的多态类型会影响奶牛的产奶性状和牛乳的一些加工特性,人们已经对其进行了广泛研究。牛αS1酪蛋白基因编码区全长17 508 bp(不计启动子序列),由19个外显子和18个内含子构成,外显子与内含子长度比例为1∶14.4。尽管其编码区突变率较高,但侧翼序列比较保守。到目前为止,牛αS1酪蛋白共发现有9种变异体,由核苷酸非同义替换、插入或缺失及外显子跳跃造成。牛αS1酪蛋白蛋白质序列及DNA序列的高度差异性揭示其编码基因可能是一个高速进化的基因家族。αS1酪蛋白基因与泌乳性状之间的关联性可以用基因调控区,特别是转录因子结合位点存在突变位点来解释。但是,有关牛αS1酪蛋白基因变异体还存在一些未探明的结果,因此,阐明其基因的结构特点并进一步揭示它们与生产性状之间的关系是非常必要的。
- 祁宏苗永旺
- 关键词:变异体多态性生产性状
- 利用微卫星标记分析迪庆黄牛的遗传多样性
- 2009年
- 采用分布在黄牛基因组15条染色体上的15个微卫星标记对迪庆黄牛60个样品进行了群体遗传变异检测分析。共检测到63个等位基因,每个座位的等位基因数从2~6不等,有效等位基因数在2.0000~4.0000之间,平均每个座位等位基因数(4.2000±0.8619)个,有效等位基因数(3.5529±0.5312)个,群体平均表观杂合度、期望杂合度及平均多态信息含量分别为0.9958±0.0161,0.7098±0.0637和0.6573±0.0851。结果表明,迪庆黄牛群体遗传变异丰富。
- 田应华钱林东凌军霍金龙祁宏刘丽仙苗永旺
- 关键词:微卫星标记杂合度多态信息含量
- 水牛β-LG基因3,4外显子遗传特征分析
- 2011年
- 本文通过PCR产物直接测序法得到水牛β-LG基因第3,4外显子及其旁侧序列后,采用PCR-RFLP和PCR-SSCP方法对属于10个群体的224头水牛该基因第4外显子进行了多态性检测,又从中随机抽取属于9个群体的69头水牛采用PCR-SSCP结合测序的方法检测了其第3外显子的遗传多态性。结果显示:河流型水牛和沼泽型水牛β-LG基因的第3外显子均为74 bp;它们的第4外显子均为111 bp;在所研究群体中,两类水牛第3,4外显子序列完全相同,并未发现具有多态现象。与牛科物种同源序列比较显示:水牛β-LG基因3,4外显子在进化上比较保守,相应于普通牛的B等位基因。由于产奶量有明显差异的河流型水牛与沼泽型水牛的β-LG基因第3,4外显子序列间无差异,提示它们对水牛产奶量无直接影响。
- 祁宏李卫真袁峰李大林刘丽仙钱坤苗永旺
- 关键词:河流型水牛沼泽型水牛PCR-RFLPPCR-SSCP
- 牛κ酪蛋白基因变异及其与奶用性状的关系
- 2010年
- 文章综述了牛κ酪蛋白基因变异特征及其对生产性状的影响,并且对目前存在问题进行了讨论和展望。
- 祁宏苗永旺
- 关键词:变异体多态性生产性状